Onderzoekers van Columbia University in New York presenteren vandaag online in Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention een nieuw-ontwikkelde prognostische biomarker voor borstkanker.¹ Prof. Dimitris Anastassiou en collega’s hebben een verbeterde versie ontwikkeld van het winnende model van de Sage Bionetworks/DREAM Breast Cancer Prognosis Challenge. Dit model was gebaseerd op attractor metagenes en een metagene gedefinieerd door de gemiddelde expressie van de beide genen FGD3 en SUSD3.

De resulterende test, genaamd BCAM (Breast Cancer Attractor Metagenes) is volgens de onderzoekers universeel toepasbaar op alle klinische subtypes en stadia van borstkanker. BCAM maakt geen gebruik van informatie over moleculair subtype of hormoonstatus. Deze informatie voegt geen additionele prognostische waarde toe. BCAM omvat het borskankerspecifieke FGD3-SUSD3 metagene, vier attractor metagenes die aanwezig zijn in meerdere kankertypen (CIN, MES, LYM en END), drie additionele individuele genen (CD68, DNAJB9 en CXCL12), tumorgrootte en het aantal positieve lymfeklieren.

‘Onze analyse leidt tot de onverwachte en opmerkelijke suggestie dat ER-, PR-, en HER2-status en moleculair subtype geen additionele prognostische waarde leveren als de waarden van de FGD3-SUSD3 en attractor metagenes in beschouwing worden genomen’, concluderen de auteurs.

1.Yang T-HO, Cheng W-Y Zheng T et al. Breast cancer prognostic biomarker using attractor metagenes and the FGD3-SUSD3 metagene.