Vroege detectie van maligniteiten berust op effectieve screening, die echter slechts voor een gering aantal maligniteiten mogelijk is. Een prospectieve patiënt-controle studie in het cohort van de Circulating Cell-free Genome Atlas (CCGA)-studie heeft de mogelijkheid onderzocht om op basis van methyleringsanalyses van circulerend tumor celvrij DNA aan- of afwezigheid van meerdere typen maligniteiten gelijktijdig te onderzoeken. Dr. Minetta Liu (Mayo Clinc, Rochester MN) en collega’s publiceren de studie vandaag online in Annals of Oncology.¹

De studie includeerde 2482 patiënten met tezamen meer dan vijftig typen maligniteiten, en 4207 controledeelnemers zonder maligniteiten. De deelnemers werden verdeeld over trainings- en validatiesets. cfDNA in bloedmonsters werd getest met een sequencing panel van meer dan 100.000 informatieve methyleringsgebieden. De onderzoekers ontwikkelden en valideerden een classifier voor detectie van aanwezigheid van een maligniteit en localisatie van tissue of origin (TOO).

De performance was consistent in de training- en de validatieset. De specificiteit voor detectie van een maligniteit was 99,3% (95%-bti 98,3-99,8), dus een false-positive rate 0,7%. De sensitiviteit voor stadium I tot en met III van twaalf veel-voorkomende typen maligniteiten was 67,3% (60,7-73,7) en voor stadium I tot en met III van alle typen maligniteiten 43,9% (39,4-48,5). De detectie nam toe met toenemend stadium. De TOO werd voorspeld in 96% van de monsters die positief waren voor een maligniteit; de TOO werd correct voorspeld in 93% van deze monsters.

De onderzoekers concluderen dat gerichte methyleringsanalyse van cfDNA tegelijktertijd detectie en localisatie van meer dan vijftig typen maligniteiten mogelijk maakte met hoger dan 90% accuratesse.

1.Liu MC, Oxnard GR, Klein EA et al. Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. Ann Oncol 2020; epub ahead of print

Summary: A prospective case-control study found that cfDNA sequencing identified methylation signatures for detection of more than 50 cancer types across stages.