Vorderingen in genoom-sequentie bepalende technieken maken wellicht voorspelling van overleving van patiënten met maligniteiten mogelijk op basis van gensignaturen. Een analyse van gegevens in The Cancer Genome Atlas en de Gene Expression Omnibus database heeft de waarde onderzocht van een prognostisch signatuur op basis van acht DNA-schadeherstel-gerelateerde genen (DRGs) voor het voorspellen van overall survival van vrouwen met mammacarcinoom (BC). Prof. Zhijun Dai (Zhejiang Universiteit, Hangzhou, China) en collega’s publiceren de analyse in JAMA Network Open.¹

De analyse is gebaseerd op gegevens van 1096 vrouwen met BC (gemiddelde leeftijd 59,6 jaar; SD 13,1). De vrouwen in The Cancer Genome Atlas vormden het trainingscohort en de vrouwen in de Gene Expression Omnibus vormden twee validatiecohorten. De analyse identificeerde acht DRGs (MDC1, RPA3, MED17, DDB2, SFPQ, XRCC4, CYP19A1, en PARP3) als prognostische biomarkers. Tijds-afhankelijke ROC-curve analyse liet zien dat het 8-genen signatuur goede accuratesse had voor het voorspellen van de overleving. In het trainingscohort was de AUC 0,708 voor drie-jaars overleving en 0,704 voor vijf-jaars overleving. In het eerste validatiecohort was de AUC 0,717 voor drie-jaars overleving en 0,772 voor vijf-jaars overleving, en in het tweede validatiecohort was de AUC 0,691 voor drie-jaars overleving en 0,718 voor vijf-jaars overleving.

De onderzoekers concluderen dat ze een 8-genen prognostisch signatuur hebben geïdentificeerd dat succesvol de overleving onder vrouwen met BC kon voorspellen.

1.Zhang D, Yang S, Li Y et al. Prediction of overall survival among female patients with breast cancer using a prognostic signature based on 8 DNA repair genes. JAMA Network Open 2020;3:e2014622

Summary: Analysis of data in The Cancer Genome Atlas and the Gene Expression Omnibus resulted in a prognostic signature based on 8 DNA repair genes that successfully predicted overall survival among female patients with breast cancer.