Recente genomische studies hebben chromosoom-rearrangements geïdentificeerd die nieuwe subtypen definiëren van B-progenitor acute lymfoblastische leukemie (B-ALL), maar in veel gevallen is de initiërende genetische verandering niet bekend. Dr. Charles Mullighan (St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis TN) en collega’s hebben een geïntegreerde genoomanalyse uitgevoerd van B-ALL in 1988 patiënten (kinderen en volwassenen). Ze publiceren de analyse online in Nature Genetics.¹

De onderzoekers voerden RNA-sequencing uit om genomische veranderingen te identificeren. De analyse resulteert in een herziene taxonomie van B-ALL in 23 subtypen, waaronder acht niet-eerder beschreven subtypen. De subtypen hebben uiteenlopende genomische en klinische kenmerken, en verschillende uitkomsten. Twee van de nieuwe subtypen worden gedefinieerd door veranderingen in het transcriptiefactor-gen PAX5. Een ander nieuw subtype wordt gedefinieerd door rearrangement van de genen voor transcriptiefactor BCL2 met MYC of BCL6. Dit subtype heeft een slechte prognose. Weer een ander subtype, gedefinieerd door rearrangement van het gen DUX4, is geassocieerd met gunstige prognose in volwassen B-ALL patiënten (dit was reeds eerder gezien in kinderen).

De onderzoekers concluderen dat de studie de mogelijkheid opent voor het categoriseren van twee-derde van tot op heden niet-gekarakteriseerde gevallen van B-ALL in subtypen met onderscheiden genetische veranderingen en klinische kenmerken. Dit zou kunnen resulteren in aanzienlijke versnelling van de ontwikkeling van op individuele patiënten toegesneden behandelingen.

1.Gu Z, Churchman ML, Roberts KG et al. PAX5-driven subtypes of B-progenitor acute lymphoblastic leukemia. Nature Genetics 2019; epub ahead of print

Summary: A genomic study at St. Jude Children’s Research Hospital (Memphis, TN) identified 23 subtypes of B-ALL, including eight new subtypes. Two-thirds of previous uncharacterized B-ALL patients could now be classified into different subtypes with distinct genetic alterations and clinical features, allowing substantially speeding up of the development of customized treatments.