Logo Jan Blom
Login

Oncologisch onderzoek.nl

Vergelijkende transcriptoomprofilering van NSCLC in zwarte en blanke NSCLC-patiënten

(0)2017-12-02 16:00   ( Nieuws )

Dr. Brid RyanDe incidentie en mortaliteit van niet-kleincellig longcarcinoom (NSCLC) in de Verenigde Staten zijn hoger onder zwarte patiënten (AAs) dan onder blanke patiënten (EAs). Een deel van dit verschil kan samenhangen met verschil in toegang tot zorg. De NCI-Maryland Case Control Study was opgezet om te onderzoeken of er ook aanwijzingen zijn voor rasgebonden biologische verschillen in de ziekte. Dr. Brid Ryan (National Cancer Institute, Bethesda MD) en collega’s publiceren de studie online in Clinical Cancer Research.1

De studie includeerde patiënten die tussen begin 1998 en eind 2014 in zeven ziekenhuizen in Maryland curatieve chirurgie ondergingen voor NSCLC. De onderzoekers voerden vergelijkende moleculaire profilering van de tumoren en normaal weefsel uit voor messenger-RNA (22 AAs, 19 EAs) en microRNA (42 AAs, 55 EAs). De analyses laten zien dat expressie van 2210 genen in NSCLC van AAs meer dan tweevoudig verhoogd of verlaagd was vergeleken met normaal weefsel. In de monsters van EAs was dit het geval voor 2921 genen.

Voor veel van deze genen was er overlap tussen beide groepen, maar er waren 637 genen die alleen in AAs en 1884 genen die alleen in EAs verschillend tot expressie kwamen tussen NSCLC en normaal weefsel. De genen die alleen in AAs differentieel tot expressie kwamen waren voornamelijk genen die koderen voor factoren die betrokken zijn bij stamcelbiologie en invasie; de genen die alleen in EAs differentieel tot expressie kwamen waren voornamelijk genen die een rol spelen in de celcyclus, mitose, en proliferatie.

De onderzoekers analyseerden de genen die differentieel tot expressie kwamen met de Connectivity Map, een model dat respons op behandelingen voorspelt. Deze analyse liet zien dat NSCLC van AAs en EAS vergelijkbare gevoeligheid hebben voor sommige maar sterk verschillende gevoeligheid voor sommige andere behandelingen. De onderzoekers identificeerden 53 middelen waarvoor EA-NSCLC gevoelig was maar AA-NSCLC resistent.

De onderzoekers concluderen dat de studie duidelijke rasgebonden verschillen heeft geïdentificeerd in de biologie van NSCLC.

1.Mitchell KA, Zingone A, Toulabi L et al. Comparative transcriptome profiling reveals coding and noncoding RNA differences in NSCLC from African Americans and European Americans. Clin Cancer Res 2017; epub ahead of print

Commentaren


Reageren op dit artikel is mogelijk na registratie.  (Login)

Nog geen commentaren