Genomische analyse is essentieel voor risicostratificatie van patiënten met AML of MDS. Whole-genome sequencing (WGS) zou een alternatief kunnen zijn voor conventionele cytogenetische analyse. Een studie van Washington University (St. Louis MO) heeft de feasibiliteit en klinische bruikbaarheid van WGS in van AML en MDS onderzocht. Prof. Eric Duncavage en collega’s publiceren de studie vandaag in The New England Journal of Medicine.¹

De studie includeerde 263 patiënten met myeloïde maligniteiten, van wie met WGS genomische profielen werden verkregen. Onder deze patiënten waren er 235 die ook succesvolle conventionele cytogenetische analyse hadden ondergaan. WGS detecteerde alle 40 recurrente translocaties en 91 copy-number veranderingen die met cytogenetische analyse waren gedetecteerd. Daarnaast identificeerde WGS ook nieuwe klinisch relevante genomische gebeurtenissen in 40 van 235 patiënten (17,0%). Prospectieve sequencing van monsters verkregen van 117 achtereenvolgende patiënten duurde mediaan 5 dagen, en leverde nieuwe genetische informatie in 29 patiënten (24,8%), resulterend in verandering van risicocategorie voor 19 patiënten (16,2%). Standaard AML-risicogroepen, zoals gedefinieerd door WGS-resultaten in plaats van cytogenetische analyse, waren gecorreleerd met klinische uitkomsten. Onder patiënten met inconclusieve resultaten van cytogenetische analyse resulteerde WGS in stratificatie in risicogroepen met meetbaar verschillende klinische uitkomsten.

De onderzoekers concluderen dat WGS snelle en accurate genomische profilering leverde van patiënten met AML of MDS, en bovendien extra klinisch relevante diagnostische informatie leverde.

1.Duncavage EJ, Schroeder MC, O’Laughlin M et al. Genome sequencing as an alternative to cytogenetic analysis in myeloid cancers. N Engl J Med 2021;384:924-935

Summary: A study at Washington University (St. Louis, MO) found that whole-genome sequencing provided rapid (median 5 days) and accurate genomic profiling in patients with AML or MDS. WGS also provided a greater diagnostic yield than conventional cytogenetic analysis and more efficient risk stratification on the basis of standard risk categories.