‘De
overeenkomsten in transcriptie-voetafdrukken tussen verschillende typen kanker
suggereert dat tumor-subtypen gewoonlijk door een beperkt aantal moleculaire
thema’s worden verenigd.’ Zo luidt de conclusie uit een studie die vandaag online in Oncogene
wordt gepubliceerd door onderzoekers van M.D. Anderson Cancer Center (Houston)
en collega’s uit Mexico en Japan.1 Corresponderend auteur van de
publicatie is dr. Roeland Verhaak, voorheen Erasmus Universiteit en Radboudumc.
De
onderzoekers vergeleken genexpressiepatronen bij twaalf tumortypes. Ze
identificeerden acht transcriptie-superclusters die worden gekarakteriseerd
door veel-geactiveerde ziekteroutes en overeenkomsten in genexpressie. Een van
de grootste superclusters werd bepaald door opregulering van een
proliferatiesignatuur, significante verrijking in TP53-mutaties, genomisch verlies van CDKN2A (p16ARF), aanwijzingen voor toename van het
aantal dubbelstrengsbreuken, en hoge expressie van cylcine B1 eiwit. Deze
correlaties suggereren dat remming van de P53-gemedieerde apoptoserespons op
DNA-schade resulteert in activering van celcyclusroutes, als gemeenschappelijk
thema in kanker. De onderzoekers zagen in negen van elf typen solide tumoren een
tweede consistent patroon, te weten een subtype dat was gerelateerd aan een
geactiveerd tumor-geassocieerd stroma.
1. Martinez E, Yoshihara K, Kim H et al. Comparison
of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer
supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects. Oncogene
2014;epub ahead of print
Commentaren
Reageren op dit artikel is mogelijk na registratie. (Login)