De onderzoekers injecteerden over een periode van vijf maanden op regelmatige tijdstippen pks+ E.coli in organoïden bereid uit de menselijke darm. Ze injecteerden controle-organoïden met een E. colistam die geen colibactine produceerde. Whole genome sequencing liet zien dat in de pks+ E. coli-geinjecteerde organoïden een mutatiesignatuur ontstond dat niet gedetecteerd werd in de controle-organoïden. Hetzelfde signatuur werd gevonden in een subset van 5876 human cancer genomes van twee afzonderlijke cohorten, vooral in CRC.
De onderzoekers concluderen dat de studie een mutatiesignatuur in CRC beschrijft, en impliceert dat het onderliggende mutatieproces resulteerde uit blootstelling van colibactine-producerende E.coli.
1.Pleguezuelos-Manzano C, Puschof J, Rosendahl Huber A et al. Mutational signature in colorectal cancer caused by genotoxic pks+ E. coli. Nature 2020; Feb 27; 1-8
Summary: A multinational study found that repeated injections of pks+ E. coli in human intestinal organoids over a period of five months induced a distinct mutational signature that was absent in organoids injected with a control E. coli strain. The same signature was found in a subset of 5,876 human cancer genomes from two independent cohorts, predominantly in CRC. The authors conclude that the underlying mutational process results directly from past exposure to bacteria carrying the colibactin-producing pks pathogeneticy island.