‘De overeenkomsten in transcriptie-voetafdrukken tussen verschillende typen kanker suggereert dat tumor-subtypen gewoonlijk door een beperkt aantal moleculaire thema’s worden verenigd.’ Zo luidt de conclusie uit een studie die vandaag online in Oncogene wordt gepubliceerd door onderzoekers van M.D. Anderson Cancer Center (Houston) en collega’s uit Mexico en Japan.¹ Corresponderend auteur van de publicatie is dr. Roeland Verhaak, voorheen Erasmus Universiteit en Radboudumc.

De onderzoekers vergeleken genexpressiepatronen bij twaalf tumortypes. Ze identificeerden acht transcriptie-superclusters die worden gekarakteriseerd door veel-geactiveerde ziekteroutes en overeenkomsten in genexpressie. Een van de grootste superclusters werd bepaald door opregulering van een proliferatiesignatuur, significante verrijking in TP53-mutaties, genomisch verlies van CDKN2A (p16^ARF), aanwijzingen voor toename van het aantal dubbelstrengsbreuken, en hoge expressie van cylcine B1 eiwit. Deze correlaties suggereren dat remming van de P53-gemedieerde apoptoserespons op DNA-schade resulteert in activering van celcyclusroutes, als gemeenschappelijk thema in kanker. De onderzoekers zagen in negen van elf typen solide tumoren een tweede consistent patroon, te weten een subtype dat was gerelateerd aan een geactiveerd tumor-geassocieerd stroma.

1. Martinez E, Yoshihara K, Kim H et al. Comparison of gene expression patterns across 12 tumor types identifies a cancer supercluster characterized by TP53 mutations and cell cycle defects. Oncogene 2014;epub ahead of print