Logo Jan Blom
Login

Oncologisch onderzoek.nl

Systematische moleculaire taxonomie van kanker

(0)2014-08-09 12:38   ( Nieuws )

Tags

kankersubtypes  

Dr. Katherine HoadleyKankers worden gewoonlijk geklasseerd aan de hand van pathologische criteria die in hoge mate bepaald worden door het weefsel waarin de kanker is ontstaan. Grootschalige genomische projecten leveren echter in toenemende mate gedetailleerde moleculaire kenmerken van tumoren, waardoor een systematische moleculaire taxonomie van kanker mogelijk wordt. Onderzoekers van The Cancer Genome Atlas Research Network publiceren in Cell (14 augustus) de uitkomsten van een dergelijke 'integrative analysis'.1 Dr. Katherine Hoadley (University of North Carolina in Chapel Hill) en collega’s bestudeerden 3527 specimens van twaalf kankertypen met vijf genome-wide platforms en één proteoom-platform. Op basis van deze analyses onderscheiden ze elf major subtypes van kanker.

Vijf van deze subtypes zijn min of meer identiek aan hun tissue-of-origin counterparts, maar verscheidene kankertypes uit verschillende weefsels convergeren in gemeenschappelijke subtypes. Zo komen squameuze longkankers, hoofd-halskankers en een subset van blaaskankers samen in één subtype dat wordt gekenmerkt door TP53 veranderingen, TP63 amplificaties, en hoge expressie van genen van immuun- en profileratieroutes. Blaaskankers splitsen zich echter over drie subtypes.

Deze nieuwe taxonomie kan onafhankelijke prognostische informatie opleveren, ‘above and beyond stage and tissue of origin’, aldus de auteurs. Nieuwe analyses kunnen ook leiden tot meer op individuele patiënten toegesneden behandelingen.

1.Hoadley KA, Yau C, Wolf DM et al. Multiplatform analysis of 12 cancer types reveals molecular classification within and across tissues of origing. Cell 2014;158;1-16

Commentaren


Reageren op dit artikel is mogelijk na registratie.  (Login)

Nog geen commentaren