Er is een
aanzienlijke diversiteit in klinische uitkomsten van Head and Neck Squamous Cell Carcinoma (HNSCC). De onderzoeksgroep
van prof. Trey Ideker (University of
California in San Diego) publiceert vandaag online in Nature Genetics een analyse
van moleculaire en klinische kenmerken
van HNSCC die van invloed zijn op de overleving van de patiënten.1 De
onderzoekers laten zien dat TP53-mutatie
frequent samen voorkomt met verlies van chromosoom 3p, en dat de combinatie van
deze gebeurtenissen geassocieerd is met een ‘surprising decrease in survival time’, van 1,9 jaar versus meer dan
5 jaar voor de TP53-mutatie alleen.
De
onderzoekers hebben gebruik gemaakt van gegevens van The Cancer Genome Atlas voor 378 HNSCC-gevallen. Ze analyseerden
somatische mutaties, chromosomale aberaties, mRNA-expressie, microRNA-expressie
en klinische variabelen, resulterend in bepalingen van meer dan 34.000 moleculaire
of klinische waarden voor elke patiënt. De TP53-3p
interactie is specifiek voor chromosoom 3p. Ideker en collega’s hebben ook
onderzocht of de TP53-3p interactie specifiek is voor alleen HNSCC. Ze hebben een
pan-cancer analysis uitgevoerd gebaseerd
op alle openbaar beschikbare moleculaire data in de atlas exclusief HNSCC, voor
weefsels van 4.404 patiënten met tezamen 17 kankertypen. Hoewel deze weefsels
moleculair heterogeen waren vonden de onderzoekers desondanks overtuigende
aanwijzingen voor zowel de co-occurence
als de impact op overleving van TP53-mutatie
en 3p-deletie.
In
HPV-positieve HNSCC-tumoren, waarin HPV leidt tot inactivering van TP53, is 3p-deletie eveneens
geassocieerd met slechtere uitkomst. De TP53-3p
gebeurtenis wordt gemodificeerd door expressie van mir-548k, die de overleving
verder verslechtert, en is wederkerig exclusief met mutaties die de
RAS-signalering beïnvloeden.
1. Gross AM, Orosco RK, Shen JP et al. Multi-tiered
genomic analysis of head and neck cancer ties TP53 mutation to 3p loss. Nature
Genetics 2014;epub ahead of print.
Commentaren
Reageren op dit artikel is mogelijk na registratie. (Login)