Het op individuele patiënten met ovariumcarcinoom toesnijden van behandelingen geschiedt op basis van klinisch-pathologische kenmerken van de ziekte. Afgezien van variaties in genen die betrokken zijn bij herstel van DNA-schade worden moleculaire kenmerken weinig gebruikt voor het beoordelen van ernst van de ziekte en schatten van de prognose van de patiënten. Een analyse van de Cancer Genome Atlas Ovarian Cancer database heeft associaties van genoombrede copy number variaties (CNVs) met overleving van patiënten met stadium I tot en met IV sereus ovariumcarcinoom geïnventariseerd. Prof. Dwayne Stupack (University of California San Diego, La Jolla) en collega’s publiceren de analyse in JAMA Network Open.¹

De analyse includeerde 564 patiënten met een diagnose sereus ovariumcarcinoom tussen begin 1992 en eind 2013. De gemiddelde leeftijd was 59,7 ± 11,5 jaar. De onderzoekers identificeerden dertien genoomregio’s met tezamen veertien veranderingen, die significant geassocieerd waren met overleving van de patiënten. De analyse resulteerde in een composiet-risicoscore die onafhankelijk was van totale CNV-belasting, totale mutatiebelasting, BRCA-status, en genoombrede DNA-schadeherstel-deficiëntiesignaturen. Tertielen van de risicoscore definieerden groepen met hoog-, standaard-, en laag-risico met mediane overall survival van 2,9 jaar (95%-bti 2,32-3,2); 4,1 jaar (3,7-4,8); en 5,7 jaar (4,7-7,4) (p<0,001). Het vijf-jaars OS-percentage in de drie groepen was 15% (95%-bti 10-22), 36% (29-46), en 53% (46-62). De risicoscore had meer onderscheidend vermogen voor het voorspellen van OS dan de combinatie van leeftijd, klinisch stadium, graad, en ras; en was sterk additief aan significante klinische kenmerken (p<0,001). De geïdentificeerde genoomregio’s waren verrijkt voor genen die koderen voor regulerende microRNAs en eiwitkinaseregulatoren.

De onderzoekers concluderen dat een CNV-gebaseerde risicoscore onafhankelijk is van en sterker is dan huidige biomarkers van OS van patiënten met sereus ovariumcarcinoom.

1.Graf RP, Eskander R, Brueggeman L, Stupack DG. Association of copy number variation signature and survival in patients with serous ovarian cancer. JAMA Network Open 2021;4:e2114162

Summary: A genetic association study using the Cancer Genome Atlas Ovarian Cancer database assessed genome-wide survival assocations in patients with serous ovarian cancer (stages I-IV). A total of 13 genome regions, comprising 14 alterations, were identified as significantly risk associated. A composite CNV-based risk score identified three risk groups with median OS of 2.9 (95% CI 2.3-3.2), 4.1 (3.7-4.8), and 5.7 (4.7-7.4) years (p<0.001). The risk score had more discriminatory ability to prognosticate OS than the combination of age, clinical stage, grade and race.