De ontwikkeling en toepassing van next-generation sequencing heeft geresulteerd in de identicatie van tot op heden 23 genen met pathogene varianten (PVs) die geassocieerd zijn met verhoogd risico van maligniteiten. Een fenoom-brede associatiestudie heeft de associatie van deze PVs met andere aandoeningen geïnventariseerd. Dr. Joshua Denny (National Institutes of Health, Bethesda MD) en collega’s publiceren de studie in JAMA Oncology.¹

De studie was gebaseerd op gegevens van 214.020 deelnemers in drie cohorten: de Electronic Medical Records and Genomic Sequencing (eMERGEseq) in de Verenigde Staten, de UK Biobank, en het Hereditary Cancer Registry (HCR) van Vanderbilt University Medical Center. De mediane follow-up na de sequencing liep tussen de drie datasets uiteen van 8,8 tot 12,7 jaar.

De analyse bevestigde de reeds bekende 38 associaties tussen PVs in 23 genen met maligniteiten, en identificeerde 19 nieuwe associaties tussen PVs in 13 genen en ziekten. Daaronder waren zeven associaties met maligniteiten, waaronder tussen PVs in CHEK2 met leukemie (OR 3,81; 95%-bti 2,64-5,48) en plasmacelneoplasmen (3,12; 1,84-5,28), PVs in ATM met maagcarcinoom (4,27; 2,35-7,44) en pancreascarcinoom (4,44; 2,66-7,40), PVs in MUTYH met niercarcinoom (32,28; 6,40-162,73), PVs in MSH6 met blaascarcinoom (5,63; 2,75-11,49), en PVs in APC met benigne lever/intrahepatische galwegtumoren (52,01; 14,29-189,29). De twaalf overige associaties waren met niet-neoplastische ziekten, waaronder ovariumcysten, pancreatitis, gastritis, en duodenitis.

De onderzoekers concluderen dat de analyse nieuwe associaties heeft gevonden tussen PVs in 13 varianten en 19 ziekten, waaronder zowel neoplastische als niet-neoplastische ziekten.

1.Zeng C, Bastarache LA, Tao R et al. Association of pathogenic variants in hereditary cancer genes with multiple diseases. JAMA Oncol 2022.0373

Summary: A phenome-wide association study using genetic and phenotypic data from three cohorts comprising 214,020 participants identified 19 new diseases and conditions associated with pathogenic variants in 13 hereditary cancer genes.