Real-time kennis van het somatisch genoom kan van belang zijn voor het management van patiënten met metastatisch castratieresistent prostaatcarcinoom. Routinematige metastatisch-weefselbiopsie is vaak problematisch in mCRPC. Analyse van circulerend tumor-DNA (ctDNA) in het plasma zou een minimaal-invasief alternatief kunnen zijn. Dr. Martin Gleave (University of British Columbia, Vancouver) en collega’s hebben onderzocht of analyse van liquide biopten een betrouwbaar alternatief is voor analyse van solide biopten in mCRPC. Ze publiceren de studie online in het Journal of the National Cancer Institute.¹

De onderzoekers voerden targeted sequencing uit over 72 klinisch relevante genen in 45 celvrij (cf) DNA-monsters die waren verkregen op het moment van biopsie van metastisch weefsel. Ze bepaalden de concordantie van mutaties en copy number alterations in DNA uit de liquide en de solide biopten. Ze zagen in 75,6% van de liquide monsters een ctDNA-gehalte van meer dan 2% van het totale cfDNA. In deze monsters werden alle somatische mutaties gezien die ook in de gematchte solide monsters werden aangetroffen. Ook de hierarchie van variant-allelfracties voor overeenkomstige mutaties kwam sterk overeen tussen liquide en solide biopten. De copy number profielen in DNA uit liquide biopten was sterk gecorreleerd met die in DNA uit solide biopten, met 88,9% concordantie voor klinisch actionabele genen. Tot de waargenomen veranderingen behoorden AR-amplificaties in tweeëntwintig liquide biopten (64,7%), SPOP-mutaties in drie (8,8%), en inactiverende veranderingen in tumorsuppressors TP53, PTEN, RB1, APC, CDKN1B, BRCA2, en PIK3R1.

De onderzoekers concluderen dat in de meerderheid van de patiënten een ctDNA-assay volstaat voor het identificeren van alle driver DNA-veranderingen die in gematcht metastatisch weefsel voorkomen.

1.Wyatt AW, Annala M, Aggarwal R et al. Concordance of circulating tumor DNA and matched metastatic tissue biopsy in prostate cancer. J Natl Cancer Inst 2017; epub ahead of print