Intrahepatisch cholangiocarcinoom (IHC) is een heterogene tumor. Onderzoekers van Memorial Sloan Kettering Cancer Center (New York) hebben met de hidden-genome classifier, een supervised machine-learning gebaseerd algoritme, de genetische heterogeniteit van IHC gekwantificeerd. Dr. William Jarnagin en collega’s publiceren de studie in Clinical Cancer Research.¹


De onderzoekers voerden een retrospectief overzicht uit van 1370 patiënten met IHC, extrahepatisch cholangiocarcinoom (EHC), galblaascarcinoom (GBC), levercelcarcinoom (HCC), of bifenotypische tumoren. Een hidden-genome model classificeerde 527 IHC-tumoren op basis van genetische homologie net EHC/GBC of HCC. Van deze IHC tumoren hadden 410 (78%) meer dan 50% genetische homologie met EHC/GBC, waaronder 122 (23%) meer dan 90% genetische homologie hadden (‘biliary class’) gekenmerkt door veranderingen in KRAS of SMAD4 en CDKN2A-verlies. De andere 177 IHC-tumoren (22%) hadden meer dan 50% genetische homologie met HCC, waaronder 30 (5,7%) met meer dan 90% homologie (‘HCC class’) gekenmerkt door TERT-veranderingen. Patiënten met biliary class versus non-biliary class IHC hadden mediane overall survival 1 jaar (95%-bti 0,77-1,5) versus 1,8 jaar (1,6-2,0) voor niet-resectabele ziekte en 2,4 jaar (2,1-NR) versus 5,1 jaar (4,8-6,9) voor resectabele ziekte. De hidden-genome classifier voorspelde OS onafhankelijk van FGFR2- en IDH-veranderingen.

De onderzoekers concluderen dat deze resultaten de differentiële responsen op behandeling van IHC zouden kunnen verklaren.

1.Song Y, Boerner T, Drill E et al. A novel approach to quantify heterogeneity of intrahepatic cholangiocarcinoma: the hidden-genome classifier. Clin Cancer Res 2024; epub ahead of print

Summary: A retrospective study quantified genetic heterogeneity of intrahepatic cholangiocarcinoma, finding a possible explanation for the differential treatment responses seen in IHC.