Analyse van circulerend tumor DNA (ctDNA) is een wellicht veelbelovende tool voor longitudinaal monitoren van het ontstaan van genomische veranderingen. Een studie van Northwestern University (Chicago IL) heeft serieel verzamelde ctDNA-monsters van patiënten met metastatisch mammacarcinoon (MBC) geanalyseerd om het ontstaan van resistentiemutaties te volgen. Prof. Massimo Christofanilli en collega’s publiceren de studie in Clinical Cancer Research.¹

De studie includeerde 86 patiënten met MBC: 44 HR+, 20 HER2+, en 22 TNBC. De patiënten stonden tenminste twee bloedmonsters af voor next-generation sequencing (NGS) analyse. Het tweede bloedmonster werd genomen na klinisch vastgestelde progressie van de ziekte. De resultaten van de NGS werden vergeleken met NGS-resultaten van ctDNA van 63 MBC-patiënten zonder aanwijzingen voor progressie. De analyses lieten zien dat progressie geassocieerd was met ontstaan van veranderingen in TP53 (p<0,0075), PIK3CA (p<0,0126), AR (p<0,0126), FGFR1 (p<0,0455), en ESR1 (p<0,0143). In het postprogressie-monster vergeleken met het baseline-monster werd hoger mutant allele frequency (MAF) en number of alterations (NOA) gezien. Ook vergelijking van postprogressie-monsters met monsters van de MBC-patiënten zonder progressie liet hogere MAF (p=0,0042) en NOA (p<0,001) in de post-progressiemonsters zien.

De onderzoekers concluderen dat seriële ctDNA-analyse ontstaan van resistentiemutaties in MBC kon detecteren.

1.Jacob S, Davis AA, Gerratana L et al. The use of serial circulating tumor DNA (ctDNA) to detect resistance alterations in progressive metastatic breast cancer. Clin Cancer Res 2020; epub ahead of print

Summary: A study at Northwestern University (Chicago, IL) found that in patients with metastatic breast cancer serial ctDNA testing could identify resistance alteration at progression. Increased mutant allele frequency and increased number of alterations were associated with disease progression.