
De onderzoekers bepaalden met 16S-rRNA sequencing de samenstelling van de microbiota in 210 Cytosponge-monsters die waren verzameld van normaal-squameuze controlepatiënten (n=20), patiënten met niet-dysplastische (n=24) en dysplastische (n=23) Barrett-slokdarm, en patiënten met slokdarmadenocarcinoom (n=19). Uit de bepalingen blijkt dat tijdens de ontwikkeling van adenocarcinoom veranderingen in de samenstelling van de microbiota plaatsvinden in de lagere slokdarm, die met de Cytosponge kunnen worden gedetecteerd vanaf het pre-invasieve stadium van hooggradige dysplasie. De belangrijkste verandering is een afname van de diversiteit van de microbiota. In de slokdarm van patiënten met adenocarcinoom werd Lactobacillus fermentum in significant (p=0,028) grotere hoeveelheden aangetroffen dan in andere stadia, en in bijna de helft van de patiënten met adenocarcinoom werd de microbiota gedomineerd door melkzuurbacteriën.
De onderzoekers concluderen dat Cytosponge-bepaalde samenstelling van de microbiota in de slokdarm in potentie kan worden toegepast voor vroege ziektedetectie.
1.Fels Elliott DR, Walker AW, O’Donovan M et al. A non-endoscopic device to sample the oesophageal microbiota: a case-control study. Lancet Gastroenterol Hepatol 2016; epub ahead of print